своего сына Карла.
Внезапный приезд Хуана в Наварру возрождает противостояние отца и сына. Недовольство Карла Вианского и его ненависть к мачехе, подкрепленные амбициями наваррской знати, приводят к гражданской войне. Хуана поддерживает знатный наваррский род Грамонов, другой род, Бомонтов, принимает сторону Карла.
Войска противников встречаются 23 октября 1451 года в битве при Эйбаре, где Карл разбит и взят в плен. Хуана Энрикес, находившаяся на поздних сроках беременности, в это время отбывает в Сарагосу, где родит сына Фернандо. Чтобы обеспечить наследование престола принцем Фернандо, Хуана Энрикес добивается, что после освобождения Карл Вианский отправляется в изгнание в Неаполь, ко двору своего дяди Альфонсо «V». Карл также вынужден пообещать, не использовать королевский титул до смерти отца.
В 1454 году Альфонсо «V» назначает Хуана своим лейтенантом (фактически соправителем) в Арагоне и Каталонии, в то время как сам правит итальянскими владениями. С 1442 года Альфонсо «V» постоянно живёт в Неаполе, окружив себя роскошью и покровительствуя учёным и художникам. В это время Хуан в Каталонии проводит ряд преобразований с целью завоевания поддержки социально незащищенных слоев населения, фермеров и ремесленников, чтобы создать противовес интересам дворян и духовенства, находившихся в оппозиции новому лейтенанту.
В 1458 году король Альфонсо «V» умирает бездетным, и Хуан наследует его владения (за исключением Неаполя, завещанного Альфонсо «V» сыну Фердинанду) под именем Хуана «II». При этом он вынужден отказаться от назначения своего сына Карла Вианского правителем Каталонии. Для Хуаны Энрикес Карл станет единственным препятствием, отделявшим её сына Фернандо от наследования престола. 25 июля 1458 года Хуан «II» предоставляет Фернандо титул герцога Монблан и графа Рибагорсы.
Под влиянием супруги Хуан «II» приказывает в 1460 году посадить Карла в заключение. Это провоцирует восстание в Каталонии, вскоре распространившееся на Арагон и Наварру. Напуганный размахом восстания, Хуан «II» в 1461 году вынужден пойти на уступки. Он освобождает Карла Вианского из заключения и признаёт его своим наследником, не отменив, однако, прав на престол Фернандо.
Карл Вианский умирает 23 сентября 1461 года от болезни легких (или, как убеждены его сторонники, отравлен по приказу Хуаны Энрикес). После его смерти каталонцы отказываются признать власть Хуана «II» и его наследника Фернандо. Приезд Хуана «II» в Барселону провоцирует начало гражданской войны. Одновременно в регионе начинается мощное крестьянское восстание. Хуан «II» сумеет сохранить лояльность Арагона, Валенсии и Сицилии, однако окажется не способным самостоятельно подавить восстание и разгромить каталонских грандов.
В начале 1462 года граф Гастон «IV» де Фуа, зять Хуана «II», организует сближение между тестем и королем Франции Людовиком «XI». Свадьба Гастона, сына графа, с Магдаленой, сестрой французского короля,
