и зачислен в распоряжение Управления по начсоставу Кр. армии. В апреле 1940 г. назначен зам. командира 64-й стрелковой дивизии в составе Калининского ВО, затем ЗапОВО. В начале Великой Отечественной войны в течение июня – июля 1941 г. полковник П. Ф. Малышев командовал 3-й запасной стрелковой бригадой в г. Смоленск. 13 июля 1941 г. командир 64-й стрелковой дивизии Западного фронта, однако дивизию не принял, так как имел задачу по обороне г. Смоленск, будучи начальником гарнизона города. После занятия его противником он был арестован и до марта 1942 г. находился под следствием, после чего был освобожден «за отсутствием состава преступления » и зачислен в распоряжение Военного совета Западного фронта. 20 апреля 1942 г. назначен зам. командира 238-й стрелковой дивизии, однако в должность не вступил. С 3 мая он принял временное командование 217-й стрелковой дивизией, которая в составе 49-й армии Западного фронта находилась в обороне по вост. берегу р. Угра (в районе Павлово). 20 августа она сдала полосу обороны 194-й стрелковой дивизии и вошла в подчинение 16-й армии. Совершив комбинированный марш в район Сухиничи, ее части вступили в оборонительные бои против наступавших 134-й пехотной и 17-й танковой немецких дивизий, имея задачу ликвидировать угрозу выхода противника на Козельск и Сухиничи. Решительными действиями они нанесли врагу значительные потери в живой силе и технике и отбросили его на южный берег р. Жиздра. В октябре переведен на должность зам. командующего 16-й армией, войска которой вели оборонительные бои на левом крыле Западного фронта в районе г. Сухиничи. С 3.5.1943 генерал-майор П. Ф. Малышев назначен временно исполняющим должность командира 8-го гвардейского стрелкового корпуса. В составе 11-й гвардейской армии Брянского, затем Прибалтийского, 2-го и 1-го Прибалтийских фронтов участвовал в Орловской, Брянской и Горо-докской наступательных операциях, в освобождении городов Карачев, Городок. За умелое командование корпусом в этих операциях он был награжден орденом Ленина (27.8.1943). С 30 декабря 1943 г. и до конца войны командовал 4-й ударной армией. Ее войска к концу 1943 г. вышли в район северо-западнее Витебска, где перешли к обороне. Летом 1944 г. армия участвовала в освобождении Белоруссии и Прибалтики. Особенно проявились его высокие командирские качества при проведении Полоцкой наступательной операции. Действуя на главном направлении 1-го Прибалтийского фронта, войска армии прорвали сильно укрепленную оборону противника, разгромили часть сил немецко-фашистской 16-й армии и вышли в район северо-западнее Полоцка. Во второй половине 1944 г. в составе 2-го и 1-го Прибалтийских фронтов армия участвовала в Режицко-Двинской, Рижской и Мемельской наступательных операциях, после чего принимала участие в блокаде Группы армий «Север» (с 26 января 1945 г. – группа армий «Курляндия»). После войны генерал-лейтенант П. Ф. Малышев с октября 1945 г. состоял в распоряжении ГУК НКО, затем с марта 1946 г. учился на ВАК при Высшей военной академии им. К. Е. Ворошилова. После окончания в июне 1947 г. назначен пом. командующего войсками БВО по строевой части. С ноября 1948 г. исполнял должность начальника