Филаретом на жительство в лавру, принялся копать там пещеры. На самом же деле за два года до этого в роще на северном берегу залива выстроили деревянные кельи, в одной из которых, вероятно, и поселился Филиппушка.
В описании Гефсиманского скита за 1899 год сказано: «…Филипп с своими сотрудниками принялся копать небольшую квадратную яму, которую впоследствии начал расширять, делать от нее подземные коридоры и в них отдельные небольшие пещерки для келий; средняя же большая предназначалась местом собрания пещерников на общую молитву». С 1849 по 1851 годы в пещерах уже работали подряженные лаврой землекопы, плотники, каменщики, превратившие среднюю пещеру в благоустроенную часовню, представлявшую собой заглубленный в землю бревенчатый сруб, с окнами, прорубленными в его верхней, выступавшей из земли части. Отходившие в разные стороны подземные ходы были превращены в обложенные кирпичом сводчатые подземные коридоры с такими же сводчатыми маленькими пещерками по сторонам. Осенью 1851 года пещерная часовня была освящена как храм во имя Сил Бесплотных.
К концу XIX века эти пещеры были значительно расширены, а над ними выстроены наземные церкви, сначала деревянные, а в конце XIX века – каменные. Скит превратился в довольно обширный комплекс в древнерусском стиле. При этом бывшая средняя пещера Филиппушки превратилась в алтарь, к которому с запада приращена обширная подземная же трапезная со сводчатым перекрытием. Южная часть возвращена монастырю, в северной располагается интернат для детей-ивалидов. В Пещерной церкви проводятся экскурсии.
При недавно имевшей место реставрации в Ново-Иерусалимском мужском монастыре были обнаружены три подземных хода, к сожалению, уже обрушившихся. Они расходятся от монастыря по разным направлениям и на разные расстояния. Из-за риска обрушений и гор мусора внутри исследовать их до конца не удалось. Ходы низкие, явно предназначавшиеся для чрезвычайных ситуаций, а не для повседневной жизни. Для осмотра доступны только их входы.
Русские помещики порой обзаводились подземными ходами в своих усадьбах. Обычно эти ходы прокладывались на небольшой глубине и давно обрушились или были намеренно засыпаны.
Усадьба Свиблово на Яузе сменила немало владельцев: от Федора Швиблы – воеводы Дмитрия Донского до купца Ивана Кожевникова, выстроившего на другом берегу реки суконную фабрику. Впрочем, он был тут не первым промышленником: еще за сто лет до этого сподвижник Петра I Кирилл Нарышкин построил тут кирпичный дом, церковь, солодовенный завод и поварню. Кто из владельцев проложил подземный ход от усадьбы до самого берега Яузы, сказать сложно, тем более что не так давно при ремонте усадьбы он был засыпан.
Существование хода в Свиблово подтверждено документально, ну а во многих случаях мы вынуждены довольствоваться лишь слухами.
В селе Авдотьино Ступинского района сохранились некоторые строения старинной усадьбы, в XVIII веке принадлежавшей известному
