сражении и в блокаде Дарданелл.
В 1772 г. принял участие в десанте контр-адмирала Самуила Карловича Грейга (Samuel Greig) (1736—1788) под крепостью Чесма.
26 апреля 1776 г. – капитан-лейтенант, командир фрегата «Унгария».
В 1777 г. служил на императорской яхте при Екатерине II-й.
7 января 1778 г. – капитан 2-го ранга, командир 66-пушечного линейного корабля «Твёрдый».
В 1779 г. – командир 32-пушечного фрегата «Наталия».
В 1780 г. на борту линейного корабля «Иезекииль» совершил круиз из Кронштадта в Португалию.
1 января 1781 г. – капитан 1-го ранга.
В 1782 г. совершил плавание из Ревеля в Кронштадт для пробы фрегатов «Святой Марк» и «Проворный».
6 апреля 1783 г. – командующий Каспийской флотилией.
21 апреля 1785 г. – капитан бригадирского ранга.
С 1786 по 1788 г. – командир 100-пушечного линейного корабля «Саратов».
22 сентября 1787 г. – капитан генерал-майорского ранга.
Принимал участие в русско-шведской войне 1788—90 г.
14 апреля 1789 г. – контр-адмирал.
Отличился в Ревельском и Выборгском морских сражениях.
С 1791 г. командовал морским эскадроном из пяти линейных кораблей и пяти фрегатов.
2 сентября 1793 г. – вице-адмирал.
5 декабря 1793 г. – главный командир Балтийского гребного флота.
В 1795 г. крейсировал у берегов Англии во главе эскадры из 12 линейных кораблей и 8 фрегатов.
10 февраля 1798 г. – член Специальной комиссии для рассмотрения штатного положения о запасных вещах в кампанию.
9 мая 1799 г. – адмирал Белого флага, командующий Балтийского флота.
В 1801 г. назначен главным командиром Кронштадского порта и директором Штурманского училища балтийского флота.
В 1808 г. назначен ответственным за охрану Санкт-Петербурга и Кронштадта с моря и должен был действовать против англо-шведской эскадры в Финском заливе, но «за неисполнение Высочайших предписаний» был подвергнут суду Адмиралтейств-коллегии, признавшей его виновным «в неосмотрительной оплошности, слабости в командовании, медлительности и нерешительности» и приговорившей к разжалованию на месяц (приговор конфирмован не был).
В 1809 г. вышел в отставку.
По свидетельству историка полковника Эразма Ивановича Стогова (1797—1880): «Ханыков был флагманом во время сражения с англичанами; за потерю корабля „Всеволод“ он был предан суду. Флот оправдывал Ханыкова; он приказал кораблю, бывшему на ветре, подать помощь „Всеволоду“, но капитан струсил и не пошёл. Суд приговорил Ханыкова разжаловать в матросы. Государь приказал разжаловать его на 12 часов, но приказа не объявлять».
Все тот же Эразм Стогов пишет о Ханыкове – «Слыл добрейшим человеком и про него ходило множество анекдотов: «Ханыков ежедневно вставал очень рано, обходил рынок, осматривал продающуюся провизию, проверял цены, покупал связку кренделей
