Кизляр в семье офицера и детские годы провёл на Кавказе. С ранних лет он слышал рассказы отца о подвигах предков и проявил большой интерес к военному делу. «Со млеком материнским, – писал впоследствии Багратион, – влил я в себя дух к воинственным подвигам».
В 1782 г. Пётр Багратион был зачислен сержантом в Кавказский мушкетёрский полк, который совместно с другими частями русской армии оборонял юго-восточную границу России от набегов горцев.
В 1788 г. с Кавказским мушкетёрским полком Багратион был направлен под Очаков. Во время штурма ворвался в крепость одним из первых, за что из подпоручиков был сразу произведён в капитаны.
В 1794 г. участвовал в Польском походе А. В. Суворова, был отмечен великим полководцем, называвшим Багратиона ласково – «князь Пётр».
В знаменитых Итальянском и Швейцарском походах Суворова отряд Багратиона находился то в авангарде, атакуя неприятеля, то в арьергарде, сдерживая его натиск. В самом начале кампании Багратион взял штурмом крепость Брешиа, атаковал и занял город Лекко, причём был ранен, но продолжал командовать. После легендарного перехода через Альпы Суворов охарактеризовал Багратиона как «наиотличнейшего генерала и достойного высших степеней» и подарил ему шпагу, с которой Багратион не расставался до конца жизни.
Во время первой войны с Наполеоном, в 1805 г., Багратиону вверен был авангард армии М. И. Кутузова, но русская армия оказалась в западне, и солдатам Багратиона пришлось прикрывать отступление основных сил. В сражении у Шенграбена он со своим 7-тысячным корпусом в течение суток сдерживал впятеро превосходящие силы противника под командованием маршала Мюрата, сумел вывести своих людей из окружения и даже захватил пленных и одно французское знамя.
В битве при Аустерлице 2 декабря 1805 года Багратион командовал правым крылом союзной армии, его солдаты стойко отражали все атаки французов, а потом прикрывали отход главных сил русско-австрийской армии.
В ходе Русско-прусско-французской войны 1806–1807 гг. Багратион вновь командовал арьергардом союзной армии. Его полки отличились в крупных сражениях на территории Восточной Пруссии – у Прейсиш-Эйлау (ныне город Багратионовск Калининградской области) и при Фридлан-де. За успешное выполнение поставленной задачи генерал-лейтенант Багратион был награждён почётным Георгиевским оружием – украшенной золотом и алмазами шпагой с надписью «За сражение при Прейсиш-Эйлау».
В 1808–1809 гг. Багратион участвовал в Русско-шведской войне. Зимой 1809 г. он возглавил поход русских войск через покрытый льдом Ботнический залив и вывел их к Аландским островам, угрожая шведской столице – Стокгольму. Это заставило Швецию подписать выгодный для России мирный договор.
Во время Русско-турецкой войны 1806–1812 гг. генерал Багратион с августа 1808 г. по март 1810 г. был главнокомандующим русской Молдавской (Дунайской) армией. Под его командованием армия одержала несколько крупных побед на правом и левом берегах Дуная, среди которых самая крупная – у Рассевата. Были осаждены и захвачены турецкие крепости Мачин, Бирсов,
