запретили в школе упоминать о вере. За религиозное воспитание родителей могли снять с работы. «Непионерство» дети переживали тяжело, но без обиды на родителей. Н. Пестов никогда не жалел времени на общение с детьми. Он подолгу беседовал с ними, сочинял детские игры, ходил на каток, играл в бадминтон, в теннис, в крокет, волейбол, учил детей плавать, катался с ними на лодке. В дни ангела и на Рождество в семье устраивались праздники, в гости приходили дети знакомых верующих людей. Одноклассников в гости не звали.
Н. Е. Пестов был зачислен сотрудником Научного института по удобрениям, ещё не окончив своего образования в МВТУ. Из МВТУ, где он работал ассистентом академика Э. В. Брицке, а позднее читал доцентский курс по технологии удобрений, он перешел во 2-ой МХТИ, а затем в Военную академию химической защиты Красной Армии им. К. Е. Ворошилова, где в должности зав. кафедрой калийных солей проработал до октября 1933 года. С осени 1933 года Николай Пестов оставил Военно-химическую академию и до осени 1937 года преподавал в МХТИ им. Менделеева, где читал курс, руководил дипломным проектированием и дипломными работами по специальности «Технология минеральных удобрений». Сверх того Н. Е. Пестов читал эпизодические лекции и циклы на предприятиях для инженерно-технического персонала, преподавал в Высшей академии комсостава промышленности и руководил аспирантами НИУ.
За эти годы Н. Е. Пестов не раз получал благодарности и поощрения за свои труды, но шел 1937 год.
Н. Пестов отказался выступить на собрании с осуждением арестованного ГПУ зав. кафедрой проф. Юшкевича, под непосредственным руководством которого он работал. За это был освобожден с работы в МХТИ им. Менделеева. Осталась работа в Научно-исследовательском институте по удобрениям (НИУИФ).
Летом 1939 г. Н. Пестов был избран по конкурсу заведующим кафедрой хим. технологии МИЭИ. Помимо этого с декабря 1942 г. по октябрь 1943 г. он был деканом химического факультета. С октября 1943 г. состоял заместителем директора по научной и учебной работе.
После защиты в январе 1941 года докторской диссертации «Физико-химические свойства порошкообразных и зернистых продуктов химической промышленности» в Академии наук СССР Н. Пестов был утвержден в степени доктора химических наук.
В годы войны Н. Е. Пестов вел интенсивную научную и педагогическую деятельность.
4 ноября 1944 г. Н. Е. Пестов был награжден орденом Трудового Кр асного Знамени, а в 1946 году – медалью «За доблестный труд в Великой Отечественной войне».
Осенью 1943 г. на фронте погиб старший сын Н. Пестова – Николай. Позднее Николай Евграфович написал книгу «Жизнь для вечности» о погибшем сыне. К концу военных лет Николай Евграфович перестал скрывать свои убеждения. Все стены своего кабинета он завесил иконами, стал ходить в храм, не боясь встретить там своих сослуживцев.
После войны Н. Е. продолжал работать в МИЭИ и по совместительству – в НИУИФ, прервав эту работу за несколько лет до выхода на пенсию.
В конце 50-х годов Н. Е. Пестовым были написаны первые труды по
