1915 г. он воевал на Юго-Западном фронте в районе с. Селиковцы. В октябре 1916 г. И. М. Алиев был направлен на учебу в Павловское военное училище. По окончании его ускоренного курса в декабре был произведен в прапорщики и назначен в 145-й пехотный Новочеркасский полк им. Александра III начальником команды пешей разведки. Воевал с ним на Румынском фронте, дослужился до поручика. После Февральской революции 1917 г. был избран в ротный, затем дивизионный комитеты. В июне 1917 г. в Одессе вступил в Красную гвардию и исполнял должность инструктора отряда. В его составе участвовал в боях с гайдамаками. После занятия города белогвардейцами с ноября был адъютантом партизанского отряда Шестопалова. 12 февраля 1918 г. отряд влился в Красную армию. В ходе боев И. М. Алиев был ранен и направлен в госпиталь в Москву. После выздоровления в ноябре он назначен старшим разведчиком в Курскую коммунистическую роту Красной армии. В том же месяце с группой одесских моряков переведен на формирование отдельного Курского батальона, где затем проходил службу адъютантом батальона, начальником команды гренадер, командиром маршевого батальона. Весной 1919 г. батальон направлен на Восточный фронт против адмирала А. В. Колчака. Там он влился в запасной полк 5-й армии. В нем И. М. Алиев служил начальником команды гренадер, командиром технической и отдельной саперной рот, начальником военно-квартирной комиссии полка. С августа 1919 г. исполнял должность пом. начальника штаба 26-й стрелковой дивизии 5-й армии. В апреле 1920 г. переведен командиром роты Одесских советских курсов комсостава, с августа был пом. заведующего и врид заведующего разведкой штаба обороны Черноморского побережья, с октября – пом. начальника и врид начальника разведки штаба 41-й стрелковой дивизии 14-й армии. В июле – сентябре 1921 г. исполнял должность пом. начальника разведывательного отделения оперативного отдела ВЧК особого отдела КВО по охране границ, затем был назначен командиром роты 194-го пограничного батальона. С января 1922 г. командовал отдельными ротами в 112-м отдельном батальоне войск ВЧК Киевского округа, в особых отделах №№ 2 и 5. С мая 1922 г. служил командиром 113-го отдельного батальона войск ГПУ. С августа 1922 г. И. М. Алиев – пом. командира 67-го стрелкового полка 23-й стрелковой дивизии УВО, затем командовал батальонами в 153-м стрелковом полку 51-й Перекопской стрелковой дивизии и в 44-м стрелковом полку 15-й Сивашской стрелковой дивизии. С апреля по июль 1924 г. прошел подготовку на подготовительном отделении Харьковских высших повторных курсов комсостава. В сентябре был откомандирован на учебу в Высшую педагогическую школу РККА, переименованную затем в Высшие военно-педагогические курсы РККА. После их окончания с августа 1925 г. был преподавателем и главным руководителем тактики Объединенной Средне-Азиатской национальной военной школы. В октябре 1927 г. переведен руководителем стрелково-тактической подготовки в Саратовскую школу переподготовки командиров запаса ПриВО. С сентября 1928 г. преподаватель, а с октября 1929 г. начальник хозяйственной части этой школы. В октябре 1930 г. переведен пом. командира по хозяйственной части 66-го стрелкового полка 23-й стрелковой дивизии