1938 г. Ф. Н. Смехотворов назначен зам. командующего войсками ХВО с присвоением воинского звания комбриг. С 13 июня 1940 г. вступил в командование 135-й стрелковой дивизией КОВО. В этой должности принимал участие в походе Красной армии в Бессарабию. Затем дивизия была передислоцирована в Зап. Украину. С началом Великой Отечественной войны дивизия в составе 27-го стрелкового корпуса 5-й армии Юго-Западного фронта вела оборонительные бои в районах нас. пунктов Владимир-Волынский, Торчин, Луцк и на р. Стырь. Особенно успешно действовала в боях род Луцком 26 июня 1941 г., прикрывая отход основных сил корпуса и всей артиллерии армии. Командир дивизии генерал-майор Ф. Н. Смехотворов организовал круговую оборону дивизии зап. Луцка. Части дивизии успешно отражали яростные атаки до двух танковых дивизий противника. В последующем дивизия вела боевые действия в районах Киверцы, Городок, Коростень, Чернигов, Короп, Пирятин. В период с 17 сентября в районе Прилуки она попала в окружение. 30 сентября генерал-майор Ф. Н. Смехотворов во главе группы штаба дивизии из 20 человек с оружием и документами сумел выйти к своим войскам на фронте 21-й армии. После этого он был направлен в штаб 40-й армии в район г. Ахтырка, где были собраны вышедшие из окружения части дивизии. В ноябре вступил в командование 45-й стрелковой дивизией, сформированной из остатков 135-й стрелковой дивизии и воронежского ополчения. В январе 1942 г. назначается врид командира 193-й стрелковой дивизии, формировавшейся в Юж.-УрВО. В апреле она была передислоцирована в Рязанскую обл., где вошла в состав 3-й резервной армии. По прибытии Ф. Н. Смехотворов в течение двух месяцев из-за болезни находился в госпитале, по излечении вновь вступил в командование дивизией, которая в это время входила в состав оперативной группы Брянского фронта и в предыдущих боях понесла большие потери. В середине августа дивизия направлена в г. Курган на переформирование. В сентябре она передислоцирована на Сталинградский фронт, где к 25 сентября была переброшена в район заводов «Баррикады» и «Красный Октябрь». В течение 50 дней ее части вели тяжелые бои в заводской части Сталинграда. За успешное выполнение заданий командования в этих боях дивизия была награждена орденом Красного Знамени. По завершении Сталинградской битвы в марте 1943 г. она была переброшена на Центральный фронт, где вошла в 65-ю армию и вела наступательные бои из района Поныри в направлении Дмитриев-Льговский. 21 марта 1943 г. за неудачные наступательные бои генерал-майор Ф. Н. Смехотворов был отстранен от командования дивизией и зачислен в распоряжение Военного совета фронта. 6 мая он был назначен врид командира 106-й Забайкальской стрелковой дивизии. В составе 70-й армии Центрального фронта участвовал с ней в Курской битве. 19 июля 1943 г. дивизия перешла в наступление и участвовала в Орловской наступательной операции. В ходе наступления 1 августа генерал-майор Ф. Н. Смехотворов был тяжело ранен и до октября находился в госпитале, затем был назначен зам. командующего войсками Юж.-УрВО по вузам. С августа 1944 г. – в той же должности в ХВО. После войны генерал-майор Ф. Н. Смехотворов в прежней должности. 10 июня 1946 г.