КГБ существовало неписаное правило: сотрудник периферийных органов переводился в центральный аппарат на должность на несколько ступеней ниже той, которую он занимал по прежнему месту службы. А Чемезов получил ту же должность – старший оперативный уполномоченный, видимо, потому, что прибыл в Москву из Дрездена. Кроме того, Чемезова, как офицера действующего резерва, назначили заместителем генерального директора «Союзспортобеспечения» – в ведомство, занимавшееся закупкой спортивной одежды и инвентаря за границей для советских спортсменов. И квартиру Чемезову дали сразу, хотя многие московские сотрудники годами ждали улучшения жилищных условий. В «Союзспортобеспечении» наиболее близкие отношения у Чемезова сложились с генеральным директором Виктором Галаевым, в прошлом комсомольским работником, начальником одного из спортивных управлений Спорткомитета СССР и секретарем парткома этого ведомства.
В начале 1990-х Галаев и Чемезов якобы занялись через посредников в Санкт-Петербурге поставками из США куриных окорочков, или, как тогда говорили, ножек Буша. Этот бизнес не мог работать официально, так как Галаев и Чемезов были госслужащими. И вот однажды, как рассказал в книге Владимир Прибыловский, «бизнесмены» якобы потеряли 100 тыс. долл., а точнее, их украла структура, которую «крышевала» могущественная казанская группировка. Далее Чемезов вышел на сотрудника 5-го управления КГБ Александра Петровича Евдокимова, бывшего куратора МВД СССР по линии Управления «3В» КГБ СССР. Евдокимов был близко знаком с верхушкой чеченской мафии, действующей в Москве в начале 90-х годов. Однако для чеченской ОПГ сто тысяч были небольшой суммой. Связываться из-за этих денег с Санкт-Петербургом Евдокимов не стал. Оставалась последняя надежда – на старого знакомого по Дрездену. А дальше – догадайтесь сами.
С сентября 1999-го по ноябрь 2000 года Чемезов возглавлял «Промэкспорт». С 2000-го по апрель 2004 года – первый зам. гендиректора «Рособоронэкспорта», затем гендиректор. На вопрос о воинском звании ответил: «Генерал-лейтенант. Впрочем, форму надеваю раз в году». Председатель советов директоров «Оборонпрома», «Корпорации Ависма», «АвтоВАЗа». Член советов директоров «КамАЗа», «НПК «Иркут», «Концерна ПВО «Алмаз-Антей», «Авиационной компании «Сухой», Казанского оптико-механического завода. В декабре 2006 года Чемезов был введен в состав бюро высшего совета «Единой России».
Чемезову уже давно было тесно в роли главного торговца российским оружием. Сначала его «Рособоронэкспорт» спасал для государства «АвтоВАЗ», потом с политическим дисконтом выкупал у частных владельцев титанового монополиста «ВСМПО-Ависма». Еще более широкое поле для деятельности Чемезов получил, возглавив госкорпорацию «Российские технологии».
В 2008-м министр финансов Алексей Кудрин обвинил «Ростехнологии» в попытке скрытой приватизации передаваемого госкорпорации федерального имущества. Глава Минфина потребовал исключить из перечня передаваемых «Ростехнологиям»
