1801 года император Александр! кроме манифеста о присоединении Грузии к Российской Империи, подписал и издал «Постановление внутреннего в Грузии управления». Согласно постановлению, в Грузии вводился общий для Российской Империи политический, административно хозяйственный и судебный порядок.
В мае 1802 года в Тбилиси состоялось торжество по случаю начала работы нового правления. Высший орган именовался «Верховное правительство Грузии», его возглавил «Главнокомандующий Грузией». В правительственный аппарат входило четыре управления, их управляющими стали русские чиновники. Для возможности наиболее полноценного общения с местным населением при управляющих всех подразделений власти были назначены советники из грузинских дворян. Старые органы управления в стране должны были постепенно устраниться.
Не всё шло гладко. Некоторые грузинские владетельные феодалы не принимали новую власть, поскольку эта власть, опираясь на регулярную армию, ставила целью практически упразднить их независимость.
Имперские власти приняли решение увеличить число грузин в местном управлении и расширить их полномочия и влияние. Так главнокомандующим Грузией на место генерала Лазарева император назначил князя Павла Ци-цианова (Цицишвили). Князь был ярким представителем Грузинской диаспоры в Москве (он родился в Москве), состоял в родстве с династией грузинских царей. Император предоставил ему неограниченные полномочия.
Князь Цицианов (1754–1806) прибыл на историческую родину в чине генерала, с административным опытом, накопленным в должности генерал-губернатора Астраханского. Вскоре деятельностью своей он убедительно показал, что выбор Российского императора был безошибочен. Он в кратчайшие сроки укрепил и улучшил имперское правление в Грузии, и создал аналогичную систему в тех областях Закавказья, которые со временем присоединялись. Под его руководительством было улучшено состояние дорог (число их возросло), наладилась почтовая связь, усовершенствовалась организация управления и порядка в городах и сельской местности.
Грузия, наконец, обрела покровительство России. Теперь уже врагам приходилось сильно уменьшить свои аппетиты. Например, в 1805 году, армия Иранского наследного принца Аббас-Мирзы (несколько десятков тысяч воинов), пошла на Тбилиси. Русские войска остановили захватчиков. Произошло сражение при Загаме. Иранцы были разбиты, рассеяны и оставили Грузинскую землю.
К числу действий, которые привели к недовольству, возмущению и сопротивлению грузин, следует, вероятно, отнести церковную реформу, проводимую имперскими властями. Реформа эта неизбежно вела к упразднению патриаршества в Грузинской Православной Церкви, которую подчинили общеимперской синодальной системе. Был учреждён Грузинский Экзархат (1811 год) и назначались экзархи не грузины. Усиленно проводилась русификация церкви, богослужения, из духовных училищ выдворялся грузинский язык. На почве недовольства этим произошло даже убийство
