Присоединение этих территорий было одной из основных задач Ивана III. Между тем, в это время ухудшилось положение православного населения Литвы. Это было связано с Польско-Литовскими Униями и проникновением католичества. В таких условиях часть православных князей, ранее подчинявшихся великому князю литовскому, стала переходить вместе со своими владениями в подданство Ивана III.
Среди них были князья Воротынские, Одоевские, Трубецкие и другие (в основном имевшие земли по восточным границам Литвы в верховьях реки Оки). Эти переходы вызвали первую русско-литовскую войну 1487 -1494 г. Война принесла победу России. Великий князь литовский Александр был вынужден признать переход князей в русское подданство.Однако вскоре вспыхнула новая война (1500 -1503). Дело в том, что на сторону Ивана III перешли и другие православные князья (среди них даже внук Дмитрия Шемяки). Крупнейшее сражение этой войны произошло в июле 1500 года на реке Ведрошь в Смоленской земле. В этой битве литовские войска были полностью разгромлены русскими. В плен попал даже сам командующий литовским войском гетман князь Константин Острожский. В результате этих двух войн в состав России были включены Чернигово- северская земля и восточная часть Смоленской земли с городами Чернигов, Новгород-Северский, Брянск, Вязьма и другими.
Иван четвёртый Грозный понимал, что взаимодействие с Европой России через враждебно настроенное Великое княжество литовское затруднено, начал в 1558 году самую длинную в истории России войну, длящуюся 25 лет. Поводом войны послужил отказ ливонцами выплачивать дань. По договору 1503 года, который завершил русско- ливонскую войну в царствование Ивана Третьего, ливонский орден обязался платить ежегодную дань Московскому государству за владение городом Юрьев (Дерпт,Тарту). Но дань не выплачивалась. Когда Иван Грозный указал, что за пятьдесят лет пора уже вернуть деньги, Ливония отказалась. Этот отказ Иван Васильевич воспринял как призыв к войне. Предлог войны был найден. Не предполагалось только , что война затянется на четверть века. Польские власти всякими средствами противодействовали православным духовным лицам сноситься со своим епископством. Дальше – больше. В 1732 году, определены были следующие узаконения: церковь католическая не должна терпеть рядом с собою других вероисповеданий, православные лишаются права избрания в депутаты на сеймы, в областные суды и в особые комиссии.
Ограничения доходили до абсурда -православным священнослужителям торжественные похороны были воспрещены вовсе и они должны были хоронить мертвых только ночью, в сёлах не должны были иметь колокола при церквях. Православие устояло в литовско-русских землях благодаря совокупности трёх причин: стойкости русского населения и особенно крестьян, заступничеству России и внутреннему разложению шляхетского общества, ускорившему падение Польши.
Все дворяне не католики образовали в 1767 году в Слуцке союз и, требуя равноправности и терпимости вероисповеданий, обратились
