Таврики, включая Ялиту, продолжало исповедовать языческую «эллинскую» веру. Присылаемые сюда Византией христианские священники всеми силами стремились искоренить «религиозное невежество». В какой-то степени им это удалось, но переход полуострова во владение хазарского каганата с его иудейским вероисповеданием снова притормозил всеобщую христианизацию.
В X веке восстановившая на полуострове свое административно-политическое и церковное управление Византия снова вовлекла Ялиту в сферу христианства. Самый старый храм в районе Ялты, Успенский, был сооружен в деревне Нижняя Аутка. Он считался одним из сильнейших сакральных мест на территории Крыма. Даже когда власть в XIII веке захватили татарские ханы, они выплачивали жалованье священникам церкви с просьбой молиться за Крым и за укрепление ханского владычества.
Исторические события, включившие Ялиту в 1380 году во владения Генуи, постепенно превратили поселение в богатую генуэзскую факторию. Генуэзские власти стремились распространить здесь католицизм, но постоянно сталкивались с противодействием греческого православного населения.
Сильное землетрясения в 1471 году разрушило генуэзскую факторию. Только через 70 лет сюда начали возвращаться греки. К этому времени Ялита, или Ялта, как ее назвали новые хозяева, уже входила в состав Османской империи и непосредственно подчинялась турецкому султану. Здесь появились новые жители – татары-мусульмане. Турки, захватив полуостров, разделили его на судебно-административные единицы, кадылыки, и поставили в поселениях, имеющих крепостные постройки, свои кордоны с военачальниками. Такой кордон находился и в Ялте.
Хозяйственная жизнь в османский период протекала в Ялте довольно живо. Велась оживленная торговля, ялтинские кораблестроители на заказ изготавливали небольшие суда для каботажного плаванья. Рыбаки каждый день отправлялись на промысел и возвращались с хорошим уловом. Крестьяне выращивали лен и табак, разводили сады и огороды. Вместе с тем, турецкие власти сразу начали вести враждебную политику против христианского населения, греков и армян.
Для ялтинцев-христиан начался период унижений и страха. Подати с них турки брали в большем количестве, чем с татар, освободив единоверцев от поголовной и брачной подати. В военные времена величина налогов вообще поднималась на огромные высоты. Каждые пять лет поселения, подчинявшиеся султану, включая Ялту, поставляли в Стамбул малолетних мальчиков для подготовки к службе в отрядах янычар. Тогда над ялтинскими берегами звучала полная тоски песня: «Что вы сидите, дети архонтов, что вы смотрите! Дракон пришел в округ и собирает мальчиков. Этот дракон есть Буюк-паша, страшный мусульманин. Имеет большой фирман с большой печатью: повелевает и собирает детей архонтов. Сорок детушек собрал. Это добро сделал нам Асан-мирза; теперь он ходит и радуется, думая собрать еще сорок. Сорок матерей-матушек воют без устали,
