Тогда же перебили казаков в других острогах. Между тем Иргень – единственное в Забайкалье священное место, с глубокой древности являющееся местом паломничества со всех уголков Забайкальского края, а также из соседних регионов. В начале XVIII столетия сибирские духовные власти сочли необходимым довести о нем до Священного Синода (Иркутские Епархиальные Ведомости за 1860-е годы), который распорядился запретить религиозные паломничества на Иргень. Это распоряжение оказалось невыполнимым, потому что в Иргень шли люди без различия вероисповедания и национальностей. Сюда для молитвы собирались не только православные, но и иноверцы, а во время молебнов и других богослужений тут молились и православный, и старовер, и буддист-ламаист, и шаманист, находящие здесь все свое благоговение. Таким образом, руководство православной епархии было вынуждено встать во главе этого всенародного паломничества и подбирать подходящую легенду. Так свидетельство протопопа Аввакума стало основой для описания чудотворных деяний на Иргени. В 1910 году было подано ходатайство в Священный Синод о создании на Иргени православного представительства. Когда в Забайкалье была организована духовная против языческая миссия и на Иргени открыт миссионерский стан, сюда стали приезжать для торжественного богослужения и епископы – начальники миссии, а со времени образования в Забайкалье самостоятельной епархии стали приезжать и правящие архиереи. Эта традиция сохранилась до сего времени, и ежегодно к 9-й после св. Пасхи пятнице на Иргень приезжает из Читы Забайкальский Владыка с паломниками. Сюда же к этому времени приходит и крестный ход из поселка Кука, преодолевая почти 80 километров. Иргенская часовня в 1862 году была переделана в церковь, которая в 1877 году сгорела. На месте старой была построена новая церковь, однако после революции Иргенская церковь была разрушена.
Создание на Иргени против языческой миссии говорит о том, что здесь было место поклонения проживающих в Забайкалье тунгусских племен, затем сюда подтягиваются для жертвоприношений живущие здесь буряты, а также староверы и православные христиане для отправления своих религиозных потребностей.
Исследователи Забайкалья часто упоминают место паломничества старообрядцев, но ни в одном описании нет объяснения названия Иргень. У историка Фишера и в «Истории Бурят-Монгольской АССР» рассказывается, что в VIII веке к северо-востоку от Байкала жило племя байегу, или байырку, где глава племени назван «великим Иркином». Однако ни к бурятам, ни к монголам гидроним Иргень не относится, а связан с такими понятиями, как «Ергени» и имя божества «Тенгри», которому поклонялось местное население. Археологическое изучение места расположения Иргенского острога проводилось (1994), и было выявлено два культурных слоя, связанных непосредственно с русским поселением, и один, датированный
