mate waartoe die virus aansteeklik is gedurende die inkubasisperiode , is onseker, maar navorsing het aangedui dat die farynx die piek virale lading ongeveer vier dae na infeksie bereik. Op 1 Februarie 2020 het die Wêreldgesondheidsorganisasie (WGO) aangedui dat "transmissie van asimptomatiese gevalle waarskynlik nie 'n groot drywer van oordrag is nie". Egter, 'n epidemiologiese model van die begin van die uitbreek in China het voorgestel dat "pre-simptomatiese beurtkrag kan tipies onder gedokumenteer infeksies wees" en dat subkliniese infeksies kan die bron van 'n meerderheid van infeksies gewees het.
Taksonies, SARS-in-2 is 'n stam van ernstige akute respiratoriese sindroom-verwante Corona (sarsr-in). Daar word geglo dat zoonotiese oorsprong het en sluit genetiese ooreenkoms met bat coronaviruses, wat daarop dui dat dit uit 'n bat-borne virusgekom het. ['N intermediêre dierereservoir soos 'n ietermagog is ook vermoedelik betrokke by sy Inleiding tot die mens. Die virus toon min genetiese diversiteit, wat aandui dat die spilliefhebber geleentheid bekendstelling van SARS-in-2 aan die mens sal waarskynlik plaasgevind het in die laat 2019.
Epidemiologiese studies beraam elke infeksie resultate in 1,4 te 3,9 nuwe mense wanneer geen lede van die gemeenskap is immuun en geen voorkomende maatreëls geneem. Die virus is hoofsaaklik versprei tussen mense deur middel van naby kontak en via respiratoriese druppels afkomstig van hoes of nies. Dit gaan hoofsaaklik uit menslike selle deur binding aan die reseptor angiotensien omskakeling ensiem 2 (ACE2).
Reservoir
––––––––
DIE EERSTE BEKENDE infeksies van die SAID-in-2-stam is in Wuhan, China, ontdek. die oorspronklike bron van virale oordrag aan die mens bly onduidelik, want of die stam patogeniese geword het pathogenic voor of na die spilliefhebber gebeurtenis. Omdat baie van die eerste individue wat gevind word om besmet te word deur die virus was werkers by die Huanan seekos mark, dit is voorgestel dat die stam kan ontstaan het uit die mark. Ander navorsing dui egter daarop dat besoekers die virus aan die mark kon bekend gemaak het, wat dan 'n vinnige uitbreiding van die infeksies gefasiliteer het.
Navorsing oor die natuurlike reservoir van die virus stam wat die 2002 veroorsaak-2004 die uitbreek het gelei tot die ontdekking van baie SARS-agtige bat coronaviruses, die meeste oorsprong in die Rhinolophus genus van perdeskoen vlermuise, en twee virale nukleolus suur rye gevind in monsters geneem uit Rhinolophus sinicus toon 'n ooreenkoms van 80% aan SARS-in-2. 'n derde virale nucleiïensuur volgorde van Rhinolophus kleintuna, versamel in Yunnan Provinsie en aangewys RaTG13, het 'n 96% ooreenkoms met SARS-in-2. vlermuise word beskou as die mees waarskynlike natuurlike reservoir van SARS-in-2, maar verskille tussen die vlermuis Corona en SARS-in-2 stel voor dat mense besmet is via 'n intermediêre gasheer.
A metagenomiese studie gepubliseer in 2019 voorheen aan die lig gebring dat SARS-in, die stam van die virus wat SARSveroorsaak, was die mees verspreide Corona onder 'n monster van sunda pangolins. [50] op 7 Februarie 2020 is aangekondig dat navorsers van Guangzhou 'n ietermagog monster ontdek het met 'n virale nucleiïensuur-reeks "99% identies" aan SARS-in-2. [51] toe vrygelaat, die resultate verduidelik dat "die reseptor-bindende domein van die S proteïen van die nuutontdekte pangolin-in is feitlik identies aan dié van 2019-nCoV, met een aminosuur verskil." [52] pangolins is beskerm onder Chinese Wet, maar hul stropery en handel vir gebruik in tradisionele Chinese medisyne bly algemeen. [53] [54]
Mikrobioloë en genetici in Texas het onafhanklik bewyse gevind van die herliortment in coronaviruses wat dui op die betrokkenheid van PANGOLINS in die oorsprong van SARS-in-2. [55] maar ietermagog coronaviruses het tot op datum slegs in die meeste 92% van hul hele genomes met die SAID-in-2, wat hulle minder soortgelyke as RaTG13 aan SARS-in-2, gemaak het. [56] dit is onvoldoende om te bewys dat pangolins die intermediêre gasheer is; in VERGELYKING, die SARS virus verantwoordelik vir die 2002-2004 uitbreek gedeel 99,8% van sy genoom met 'n bekende civet Corona.
PERDESKOEN VLERMUISE is onder die mees waarskynlike natuurlike reservoirs van SARS-in-2
Phylogenetika en taksonomie
SARS-in-2 behoort aan die breë familie van virusse bekend as coronaviruses. Dit is 'n positiewe-sin enkel-gestrand RNA (+ssrna) virus. Ander coronaviruses in staat is om veroorsaak siektes wat wissel van die gewone verkoue tot meer ernstige siektes soos Midde-Ooste respiratoriese sindroom (MERS). Dit is die sewende bekende Corona om mense te besmet, na 229e, NL63, OC43, HKU1, MERS-in, en die oorspronklike SARS-in. [57]
Soos die SARS-verwante Corona spanning wat betrokke is in die 2003 SARS-uitbreking, is SARS-in-2 'n lid van die subgenus sarbecovirus (beta-in geslagb). [58] [59] sy RNA - reeks is ongeveer 30 000 basisse in lengte. SARS-in-2 is uniek onder bekende betakels , in sy inlywing van 'n polybasiese Cleavage-webwerf, 'n eienskap wat bekend patogenisiteit en oordraagbaarheid in ander virusse verhoog word. [60] [61]
Met 'n voldoende aantal opeenvolg genomes, is dit moontlik om 'n phylogenetiese boom van die mutasie geskiedenis van 'n familie van virusse te herkonstrueer. Teen 12 Januarie 2020 is vyf genomes van SARS-in-2 van Wuhan geïsoleer en deur die Chinese Sentrum vir siektebeheer en voorkoming (ccdc) en ander instellings gerapporteer; [62] die getal genomes het teen 30 januarie 2020 tot 42 gestyg. [63] 'n phylogenetiese analise van daardie monsters het gewys dat hulle "hoogs verwant is aan die meeste sewe mutasies relatief tot 'n algemene voorouer", wat impliseer dat die eerste menslike infeksie in November of Desember 2019 plaasgevind het. [63] vanaf 27 maart 2020, 1 495 SARS-in-2 genomes is op ses kontinente beskikbaar gestel. [64]
Op 11 Februarie 2020 het die internasionale komitee oor taksonomie van virusse (ictv) aangekondig dat volgens bestaande reëls wat hiërargiese verhoudings onder coronaviruses bereken op grond van vyf behoue rye nukleolus sure, die verskille tussen wat dan 2019-nCoV genoem word en die virus- stam van die 2003 SARS-uitbreking was onvoldoende om hulle te laat skei virale spesies. Daarom, hulle geïdentifiseer 2019-nCoV as 'n stam van ernstige akute respiratoriese sindroom-verwante Corona. [2]
|
|
|
| NCBI GENOOM ID | MN908947 |
| Genoom grootte | 29 903 basisse |
| Jaar van voltooiing | 2020 |
STRUKTURELE BIOLOGIE
Elke SARS-in-2 virion is ongeveer 50 – 200 nanometres in deursnee. Soos ander CORONAVIRUSES, SARS-in-2 het vier strukturele proteïene, bekend as die S (piek), E (koevert), M (membraan), en N (nukleocapsid) proteïene; die N proteïen hou die RNA genoom, en die s, E, en M proteïene saam skep die virale koevert. [65] die piek-proteïen, wat op die atoomvlak is met die gebruik van die lakogeniese elektronmikroskopie,[66] [67 ] is die proteïen wat verantwoordelik is vir die toelaat van die virus om aan te heg en te maak met die membraan van 'n gasheersel.
––––––––
