и Ньют засыпают в медлаборатории. Проснувшись, Рипли обнаруживает, что её оружие исчезло, дверь заблокирована, а два живых Лицехвата выпущены из своих колб. Рипли удаётся запустить систему пожарной тревоги, благодаря чему вовремя подоспевшие десантники успевают спасти их с Ньют и убить Лицехватов. После этого Рипли сообщает, что это работа Бёрка: по его плану Рипли и Ньют доставили бы на Землю в качестве образцов инфицированных Чужими (поскольку в гиперсне биологические часы человека замедляются, то Чужой не успел бы созреть к прибытию на Землю). Выслушав Рипли, десантники решают расстрелять Бёрка, но в этот момент освещение отключается, а оба датчика движения засекают внутри комплекса движение Чужих, которым удалось обойти все баррикады, пробравшись в потолочное пространство комплекса. Солдаты открывают огонь, прикрывая отступление Рипли, Ньют и Бёрка. Бёрк устремляется вперёд и закрывает двери перед десантниками, но попадает прямо в лапы к одному из Чужих. Остальные вынуждены идти через вентиляционные каналы, но в итоге в живых остаются лишь Хикс, Рипли и Ньют. Горман, прикрывая тыл, взрывает себя и раненную Васкес гранатой, однако взрывная волна сбивает с ног Ньют, и она падает на нижний этаж комплекса. Хикс и Рипли пытаются её вытащить, но Чужие уносят девочку в улей. Рипли помогает раненому Хиксу дойти до челнока, который Бишоп успел вызвать с «Сулако», и, приказав последнему лететь к атмосферному процессору, вооружается и спускается в улей. По датчику слежения, который она надела на Ньют раньше, Рипли находит и спасает девочку, в последний момент уничтожая напавших на нее Лицехватов. Спасаясь от очередного взрыва, который теперь сотрясает реактор, Рипли попадает в зал Королевы-Матки Чужих, которая и откладывает яйца.
Отступая Рипли выпускает струю огня в воздух, а затем направляет ствол огнемёта на яйца. Королева в ответ отзывает своих немногочисленных воинов, уцелевших после сражения с людьми, и разрешает женщине уйти. Но в этот момент яйца начинают раскрываться, и Рипли сжигает их из огнемёта, а затем из подствольного гранатомёта взрывает яйцеклад Королевы. Королева, разъяренная смертью своего потомства, отрывается от яйцеклада и бросается в погоню за Рипли. Бишоп подлетает к посадочной платформе, чтобы забрать Рипли и Ньют, но в этот момент атмосферный процессор начинает разрушаться – сильная взрывная волна бросает челнок на платформу, прямо в кучу обломков, и тот застревает в них. Тем не менее, взлететь всё же удаётся. Выйдя на орбиту, Рипли и Бишоп видят, как термоядерный взрыв уничтожает колонию и корабль Чужих.
Но по возвращении на «Сулако» выясняется, что Королева во время приземления челнока спряталась в нише для его шасси. Она разрывает Бишопа и преследует Ньют в ангаре. Рипли, используя робота-погрузчика, выбрасывает чудовище в космос, устроив аварийное открывание шлюза. Разорванный пополам Бишоп спасает Ньют, удерживая
