Математические модели в естественнонаучном образовании. Том II. Денис Владимирович Соломатин
Чтение книги онлайн.
Читать онлайн книгу Математические модели в естественнонаучном образовании. Том II - Денис Владимирович Соломатин страница 7
Таблица 5.4. Расстояния между таксонами
.31 1.01 .75 1.03
1.00 .69 .90
.61 .42
.37
Начинаем с выбора ближайшей пары таксонов для присоединения, как это делали в UPGMA. Глядя на таблицу расстояний,
и и до до оно равно . Это дает таблицу 5.5.Таблица 5.5. Расстояния между группами; FM-алгоритм, шаг 1a
.31 .93
.863
Имея только три таксона в этой таблице, можем точно подогнать данные к дереву, используя 3-точечные формулы, чтобы получить рисунок 5.10. Ключевым моментом здесь является то, что 3-точечные формулы, в отличие от UPGMA, могут давать неравные расстояния таксонов от общего предка.
Рисунок 5.10. FM-алгоритм; шаг 1.
Теперь оставляем только ребра, заканчивающиеся в
и и , объединяем их в группу для остальной части алгоритма, как сделали бы с UPGMA. Это формирует таблицу 5.6.Таблица 5.6. Расстояния между группами; FM-алгоритм, шаг 1b
1.005 .72 .965
.61 .42
.37
Снова ищем ближайшую пару (теперь это
и и , в одну временную группу и вычисляем расстояния